《上海话大词典(拼音输入版)》采用“上海话拼音方案”标音，使用26个拉丁字母对上海话语音进行注音。这个拼音方案是2006年11月在“首届上海方言国际学术研讨会”上由出席会议的专家和网友集体审定的。当前，上海话的语音有老派和新派两种发音。老派音大致在45岁以上的上海人中使用，新派音大致在45岁以下的上海人中使用。新派的音系比老派简化，且在多数上海人中使用，本词典采用新派语音标音。
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