《QUAL2K河流水质模拟模型理论方法与应用指南》共分5个章节。第1章“模型概述”简单介绍了QUAL2K模型的发展历程和主要模型特性；第2章“模型基础结构”介绍了QUAL2K模型的河网概化和拓扑构建、点面源概化方法；第3章“模型数学方法”详细介绍了QUAL2K模型包含的水力学模型、温度一热通量模型和水质模型的基本物理机理、主要反应过程概化、模型方程和求解方法等，使模型使用者可以充分了解QUAL2K模型的主要原理和方法；第4章“系统需求与模型安装”介绍了QUAL2K模型的系统需求和安装方法；第5章“模型使用指南”详细介绍了QUAL2K模型的模型界面、输入数据、参数设置、输出结果和推荐模型参数取值等，以方便使用者掌握模型使用方法。
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