《保护生物学原理》以如何防止物种灭绝为主线，结合中国实际，介绍保护生物学的基本原理和实践方法。《保护生物学原理》回顾了保护生物学产生的历史背景，吸收了新问题、新思想、新理论和新方法，探讨了学科特征与学科结构。探索了物种大灭绝原因和研究方法，介绍了物种濒危等级评估方法，阐述了中国物种多样性格局及其成因、有关全球变化的不同观点及全球变化对生物分布格局的可能影响，探讨了生命伦理、动物意识、动物福利、动物权利、生态足迹、公共物品、野生生物所有权、自然资源法、遗传资源惠益分享、生态系统服务功能、运动狩猎与战利品狩猎、野生生物国际贸易、保护成本与生态文明等热点问题。介绍了遗传多样性、生态系统多样性、生物多样性热点地区及生态系统服务功能、千年生态系统评估、遗传资源保护和惠益分享问题，并介绍了动物行为与物种保护、种群生存力分析、濒危物种就地保护与异地保护方法和濒危野生动植物国际贸易及社区、生计、传统文化与自然保护等问题，并提供了保护生物学名词。
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