《全国主体功能区决策支持系统研究》详细分析了全国主体功能区规划对信息技术的需求，在此基础上提出了全国主体功能区规划辅助决策支持系统的功能需求与设计、指标体系，对主体功能区规划模型库系统、主体功能区辅助决策支持系统核心功能、主体功能区规划辅助决策支持系统集成、主体功能区规划信息资源体系化和标准化、主体功能区综合信息库系统、主体功能区规划辅助决策空间信息平台、主体功能区辅助规划决策支持系统环境建设、主体功能区辅助决策支持系统应用等主体功能区规划辅助决策支持系统的各个环节和重点内容进行了深入研究，依托全国主体功能规划辅助决策支持原型系统，利用主体功能区规划相关背景和监测数据，对近几年来的全国主体功能区进行了动态监测评估。
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