《博学切问》分为以下几个部分：“学问踪迹”主要是读书兴趣及研究方法；“认知科学”部分收录作者在开展认知科学及其哲学思考研究中的一些随笔；“机器智能”则从智能研究者的角度讨论了大众最为关心的“机器能否超越人类”等话题；“音乐审美”收入了关于音乐，特别是古琴音乐认知与计算研究的一些研究心得；“语言探微”主要讨论语言学的前沿研究动向，让读者知其然并知其所以然；“禅学蠡测”讨论了有关禅宗史迹、禅法思想和禅思随想之类的东西；“国故新知”从科学角度阐发了中医的科学性问题、灵魂存在性问题、周易占卜灵验问题等等。
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